단일세포 공간 전사체학을 이용한 종양 미세환경 내 면역세포-암세포 상호작용 매핑 기법

단일세포 공간 전사체학은 조직 내 특정 세포들의 유전자 발현 정보를 잃지 않고, 그들 간의 3차원적 공간 관계를 동시에 파악할 수 있게 해주는 첨단 분석 플랫폼입니다.

핵심 분석 전략

• 상호작용 벡터 정량화: Spatial transcriptomics 데이터를 이용하여 암세포와 침윤 림프구(TILs) 등 면역세포의 상대적 거리를 측정하고, 이 거리가 특정 사이토카인 또는 면역 체크포인트 발현 수준과 어떻게 상관관계가 있는지 분석합니다.
• 이종 세포 클러스터링: 고해상도 단일세포 분석 결과를 공간적 맥락 위에 투영하여, 특정 종양미세환경(TME) 내에서 면역회피(Immune Evasion)를 수행하는 세포 유형의 국소적 밀도 분포를 확인합니다.

이 기법은 전통적인 bulk sequencing으로는 불가능했던 TME 내 미세한 세포 간 신호 교환 패턴을 밝혀내며, 이를 통해 최적의 면역항암치료 타겟을 선정하는 데 필수적인 정보를 제공합니다. 공간 전사체학, 종양미세환경, 면역항암치료